Dash Bio⑪（Clustergram）

Clustergram

Clustergramコンポーネントを使うと、２次元のクラスター分析を可視化することができます。

クラスター分析とは、大きな集団の中から似たもの同士を集めてグループに分ける統計的な分析手法です。

Dash Enterprise - https://dash.plotly.com/dash-bio/clustergram

上記のDash Enterpriseにあるサンプルを参考にして、２次元のクラスター分析を視覚化します。

[ソースコード]

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import pandas as pd
import dash
import dash_bio as dashbio
from dash import dcc

app = dash.Dash(__name__)

df = pd.read_csv('https://git.io/clustergram_brain_cancer.csv').set_index('ID_REF')

columns = list(df.columns.values)
rows = list(df.index)

app.layout = dcc.Graph(figure=dashbio.Clustergram(
                           data=df.loc[rows].values,
                           column_labels=columns,
                           row_labels=rows,
                           color_threshold={
                               'row': 250,
                               'col': 700
                           },
                           hidden_labels='row',
                           height=700,
                           width=1000
                           )
                       )

if __name__ == '__main__':
    app.run_server(debug=True)

[ブラウザで表示]

２次元のクラスター分析を可視化することができました。

ドラッグ操作により表示範囲を変えることができます。