FornaContainer
FornaContainerコンポーネントを使うと、RNA分子の２次元構造を可視化することができます。
Dash Enterprise - https://dash.plotly.com/dash-bio/fornacontainer
上記のDash Enterpriseにあるサンプルを参考にして、RNA分子の２次元構造を視覚化します。
[ソースコード]
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| import dash
import dash_bio as dashbio
app = dash.Dash(__name__)
sequences = {
'PDB_01019': {
'sequence': 'AUGGGCCCGGGCCCAAUGGGCCCGGGCCCA',
'structure': '.((((((())))))).((((((()))))))'
},
'PDB_00598': {
'sequence': 'GGAGAUGACgucATCTcc',
'structure': '((((((((()))))))))'
}
}
app.layout = dashbio.FornaContainer(sequences=[sequences['PDB_01019'], sequences['PDB_00598']])
if __name__ == '__main__':
app.run_server(debug=True)
|
[ブラウザで表示]
RNA分子の２次元構造を可視化することができました。
ドラッグ操作により全体の表示位置を変えたり、分子構造をつかんで移動したりすることができます。