Dash Bio⑭(ゲノムブラウザ IGV)

ゲノムブラウザ IGV

IGVコンポーネントを使うと、ゲノム情報を視覚化することができます。

IGVIntegrative Genomics Viewer の略です)

Dash Enterprise - https://dash.plotly.com/dash-bio/igv

上記のDash Enterpriseにあるサンプルを参考にして、ゲノム情報を視覚化してみます。

[ソースコード]

1
2
3
4
5
6
7
8
9
import dash
import dash_bio as dashbio

app = dash.Dash(__name__)

app.layout = dashbio.Igv(genome='ce11', minimumBases=100)

if __name__ == '__main__':
app.run_server(debug=True)

[ブラウザで表示]

ゲノム情報を可視化することができました。

ドラッグすることにより、表示位置を変えたり、拡大・縮小して表示することができます。