Dash Bio⑮（マンハッタンプロット）

マンハッタンプロット

ManhattanPlotコンポーネントを使うと、マンハッタンプロットを表示することができます。

マンハッタンプロットは、多数のデータポイント、非ゼロ振幅、および高い振幅値の分布を持つデータを表示します。

一般的にゲノムワイド関連解析（GWAS）で使用され、重要なSNP（個人間の遺伝情報のわずかな違いのこと。一塩基多型とも呼ばれる。）を表示することができます。

Dash Enterprise - https://dash.plotly.com/dash-bio/manhattanplot

上記のDash Enterpriseにあるサンプルを参考にして、マンハッタンプロットを表示します。

[ソースコード]

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import pandas as pd
import dash
import dash_bio as dashbio
from dash import dcc

app = dash.Dash(__name__)

df = pd.read_csv('https://git.io/manhattan_data.csv')

app.layout = dcc.Graph(figure=dashbio.ManhattanPlot(dataframe=df))

if __name__ == '__main__':
    app.run_server(debug=True)

[ブラウザで表示]

マンハッタンプロットを表示することができました。

ドラッグすることにより、表示位置を変えたり、拡大・縮小したりすることができます。

また凡例を選択して、データの表示・非表示を切り替えることもできます。