Dash VTK⑧(Multi-View with slicing)

Multi-View with slicing

Multi-View with slicingを使うと、物体データを3面からスライスしたイメージを表示することができます。

頭部データとして下記のファイルをダウンロードし、ソースコードと同じフォルダに格納します。

頭部データ - https://github.com/plotly/dash-vtk/blob/master/demos/data/head.vti

下記のソースコードでは、人体の頭部を3面からスライスした3Dビューを表示します。18行目で、ダウンロードしたファイル(head.vti)の位置を指定しています。

[ソースコード]

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
import os
import random

import dash
import dash_bootstrap_components as dbc
import dash_html_components as html
import dash_core_components as dcc
from dash.dependencies import Input, Output, State

import dash_vtk
from dash_vtk.utils import to_volume_state

import vtk

random.seed(42)

# Data file path
head_vti = "head.vti"

# Load dataset from dist
reader = vtk.vtkXMLImageDataReader()
reader.SetFileName(head_vti)
reader.Update()

volume_state = to_volume_state(reader.GetOutput())

sliders = {
"Slice i": dcc.Slider(id="slider-i", min=0, max=256, value=128),
"Slice j": dcc.Slider(id="slider-j", min=0, max=256, value=128),
"Slice k": dcc.Slider(id="slider-k", min=0, max=95, value=47),
"Color Level": dcc.Slider(id="slider-lvl", min=0, max=4095, value=1000),
"Color Window": dcc.Slider(id="slider-window", min=0, max=4095, value=4095),
}

controls = dbc.Card(
body=True,
children=dbc.Row(
[
dbc.Col([dbc.Label(label), component], style={"width": "150px"})
for label, component in sliders.items()
]
),
)

slice_property = {"colorWindow": 4095, "colorLevel": 1000}

slice_view = dash_vtk.View(
id="slice-view",
cameraPosition=[1, 0, 0],
cameraViewUp=[0, 0, -1],
cameraParallelProjection=False,
background=[0.9, 0.9, 1],
children=[
dash_vtk.ShareDataSet(dash_vtk.Volume(state=volume_state)),
dash_vtk.SliceRepresentation(
id="slice-repr-i",
iSlice=128,
property=slice_property,
children=dash_vtk.ShareDataSet(),
),
dash_vtk.SliceRepresentation(
id="slice-repr-j",
jSlice=128,
property=slice_property,
children=dash_vtk.ShareDataSet(),
),
dash_vtk.SliceRepresentation(
id="slice-repr-k",
kSlice=47,
property=slice_property,
children=dash_vtk.ShareDataSet(),
),
],
)

app = dash.Dash(__name__, external_stylesheets=[dbc.themes.BOOTSTRAP])
server = app.server

app.layout = dbc.Container(
fluid=True,
style={"height": "calc(100vh - 30px)"},
children=[
html.Div(
style={"height": "20%", "display": "flex", "alignItems": "center"},
children=[
html.Br(),
controls,
html.Br(),
],
),
html.Div(slice_view, style={"height": "80%"}),
],
)

@app.callback(
[
Output("slice-view", "triggerRender"),
Output("slice-repr-i", "property"),
Output("slice-repr-i", "iSlice"),
Output("slice-repr-j", "property"),
Output("slice-repr-j", "jSlice"),
Output("slice-repr-k", "property"),
Output("slice-repr-k", "kSlice"),
],
[
Input("slider-i", "value"),
Input("slider-j", "value"),
Input("slider-k", "value"),
Input("slider-lvl", "value"),
Input("slider-window", "value"),
],
)
def update_slice_property(i, j, k, level, window):
render_call = random.random()
slice_prop = {"colorLevel": level, "colorWindow": window}
return render_call, slice_prop, i, slice_prop, j, slice_prop, k


if __name__ == "__main__":
app.run_server(debug=True)

[ブラウザで表示]

人体の頭部を3面からスライスした3Dビューが表示されました。

コントローラを使って各面のスライス位置色合いを変えたりすることができます。

またドラッグすることにより角度を変えて表示したり、スクロールで拡大・縮小したりすることも可能です。